Добрый день.
Цитата: По итогу года пересчитать и вернуть ему переплату или оставить налогооблагаемую базу равной 0 и оставить все как есть
По итогам года (и даже по итогам любого месяца) налогооблагаемая база в вашем случае никак не может быть равна 0. Не забывайте, что НДФЛ считается нарастающим итогом.
Доход за 12 месяцев 5750*12=69000
Вычеты:
2800*12=33600
3000*3=9000
Всего вычетов за 12 месяцев 42600
Налогооблагаемая база 26400
Исчисленный налог за год 3432.
А вот излишне удержанный налог вполне может появиться. Уже в октябре.
По сентябрь месяц был удержан налог
(5750*9-2800*9)*0,13=3452.
А исчисленный налог по итогам года составил 3432 рубля. Итого 20 рублей излишне удержано.
Что делать с излишне удержанным налогом, подробно указано в ст. 231 НК РФ.
И уже с 2018 года (если ничего не изменится) налогооблагаемая база каждого месяца будет равна 0. В этом году ничего пересчитывать не придётся.